Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTF2Q9UNY4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms