Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNP9

PPIE, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIEQ9UNP9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPIEQ9UNP9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms