Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX6Q9UNH7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms