Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms