Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CIZ1Q9ULV3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms