Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PADI1Q9ULC6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PADI1Q9ULC6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms