Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA3Q9UI47 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA3Q9UI47 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms