Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGXB4Q9UGU5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms