Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms