Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms