Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms