Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HCN3Q9P1Z3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms