Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms