Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VNN3Q9NY84 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms