Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AIPQ9NXV6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms