Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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