Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CWC25Q9NXE8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms