Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMBRD1Q9NUN5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms