Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRN4Q9NRL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRN4Q9NRL3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms