Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP4Q9NRJ4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms