Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH2B1Q9NRF2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH2B1Q9NRF2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms