Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MMP26Q9NRE1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms