Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DUOX2Q9NRD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DUOX2Q9NRD8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms