Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LHX9Q9NQ69 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms