Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC3GQ9HC16 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms