Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPF2Q9H7B2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPF2Q9H7B2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms