Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms