Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms