Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NYXQ9GZU5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms