Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2J2Q9GZM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms