Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP74Q9C0B2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP74Q9C0B2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms