Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CELF4Q9BZC1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms