Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.51■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HIRIP3Q9BW71 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms