Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf16Q9BUW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms