Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF8Q9BRL6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms