Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRBNQ96SW2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRBNQ96SW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms