Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT4

TRPM7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM7Q96QT4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPM7Q96QT4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms