Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF396Q96N95 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms