Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC43Q96MW1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC43Q96MW1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC43Q96MW1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC43Q96MW1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC43Q96MW1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms