Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms