Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS50Q96JG6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms