Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms