Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDC3Q96F86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDC3Q96F86 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms