Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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