Protein–RNA interactions for Protein: Q96D96

HVCN1, Voltage-gated hydrogen channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HVCN1Q96D96 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HVCN1Q96D96 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HVCN1Q96D96 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms