Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FAF2Q96CS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms