Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCE1Q969G3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCE1Q969G3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms