Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP9XQ93008 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP9XQ93008 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms