Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAAF4Q8WXU2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms