Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC107Q8WV48 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC107Q8WV48 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms